ما هي الاختلافات بين MDA و DOP/PEP
MDA قابل للتطوير مع إنتاج قابل للتعديل من كميات ميكروجرام إلى ملجم، في حين ينتج DOP عادة 2-3 ميكروجرام من الحمض النووي لكل تفاعل. كما ينتج DOP منتجًا أقصر غير مناسب لتطبيقات لاحقة معينة (مثل Southern blot واستنساخ جزئي). منتجات DOP وPEP هي
هذه هي تفاعل البوليميراز المتسلسل الأوليجونوكليوتيدي المتحلل (DOP-PCR) (1) وتضخيم تمديد البادئ (PEP) (2). الفرق الرئيسي بين التقنيتين هو أن PEP يستخدم
تقييم التحيز الناجم عن تضخيم الجينوم الكامل
23 أغسطس 2006كانت الاختلافات بين طرق MDA طفيفة، وخاصة في ضوء الانعكاس المذكور أعلاه في مرتبة التحيز في تحليل سلة القاعدة 10 لـ C. jejuni. (6 قواعد لـ MDA،
النتائج. قمنا بمقارنة مزايا وعيوب طرق WGA المختلفة بشكل منهجي، مع التركيز بشكل خاص على اكتشاف الاختلافات. التغطية المنخفضة بالكامل
تضخيم الجينوم الكامل والتعدد
تم تطوير العديد من الطرق لتضخيم الجينوم الكامل عالي الدقة، بما في ذلك الطرق القائمة على تفاعل البوليميراز المتسلسل مثل تفاعل البوليميراز المتسلسل للأليغنوكليوتيدات المنحلة (DOP-PCR) وتضخيم تمديد البادئ (PEP)، ولكن الأكثر
تظهر الاختلافات الرئيسية بين طرق WGA الأولية في الجدول 1. تم تحسين طريقة التضخيم هذه
بوليميرات الحمض النووي لتضخيم الجينوم الكامل:
تهدف تقنية MDA القائمة على PrimPol إلى التغلب على بعض مشاكل طرق MDA القائمة على البادئات العشوائية، وخاصة في بروتوكولات تضخيم الخلية الواحدة. بشكل عام، يمكن توسيع نطاق هذه التقنية القائمة على البادئات مع إمكانية تعديل العائدات من كميات ميكروجرام إلى ملجم، في حين ينتج DOP عادةً 2-3 ميكروجرام من الحمض النووي لكل تفاعل. كما ينتج DOP منتجًا أقصر غير مناسب لتطبيقات لاحقة معينة (على سبيل المثال Southern blot
تضخيم وتسلسل الجينوم الكامل للخلية الواحدة:
نقدم دراسة استقصائية لأساليب تضخيم الجينوم الكامل للخلية الواحدة (WGA)، بما في ذلك تفاعل البوليميراز المتسلسل المتحلل بالنيوكليوتيدات الأولية (DOP-PCR)، والاختبارات المتعددة
الوقاية قبل التعرض (PrEP) مخصصة للأشخاص الذين لا يعانون من عدوى ولكنهم معرضون لخطر كبير للإصابة بها. أما الوقاية بعد التعرض (PEP) فهي مخصصة للأشخاص الذين ربما تعرضوا لفيروس أو بكتيريا.
- ما هو الفرق بين DOP PCR وPep PCR؟
- وهما Degenerate Oligonucleotide PCR (DOP-PCR) (1) وPrimer Extension Preamplification (PEP) (2). الفرق الرئيسي بين التقنيات هو أن PEP يستخدم بادئات عشوائية ودرجة حرارة منخفضة لتلدين PCR، بينما يستخدم DOP-PCR أوليجونوكليوتيدات شبه متحللة (أي CGACTCGAGNNNNNNATGTGG) ودرجة حرارة متزايدة للتلدين.
- ما هو تضخيم الحمض النووي بالإزاحة المتعددة (MDA)؟
- على النقيض من ذلك، فإن تضخيم الحمض النووي بالإزاحة المتعددة (MDA) هو تقنية تضخيم جينوم كامل متساوية الحرارة قوية جدًا يمكنها تضخيم كميات صغيرة جدًا من الحمض النووي الدائري أو الخطي دون الحاجة إلى تصميم بادئ.
- ما هو الفرق بين تضخيم MDA وPCR؟
- على النقيض من تضخيم PCR، لا يتطلب MDA درجات حرارة مختلفة وينتهي بشظايا طويلة جدًا بمعدلات طفرة منخفضة. لا ينفصل بوليميراز Phi 29 عن قالب الحمض النووي الجينومي، مما يسمح بتوليد شظايا الحمض النووي حتى 100 كيلو بايت دون تحيز التسلسل.
- كيف يعمل Repli G MDA؟
- توفر تقنية REPLI-g MDA أطوال قراءة طويلة مع تضخيم متساوي الحرارة. تلتصق البادئات (الأسهم) بقالب الحمض النووي وتمتد عند 30 درجة مئوية بواسطة بوليميراز Phi 29، الذي يتحرك على طول خيط قالب الحمض النووي، مما يؤدي إلى إزاحة الخيط التكميلي بينما يصبح قالبًا بحد ذاته للتضاعف.
